A AJAP desde a sua génese desenvolve uma estratégia de cooperação que privilegia os Países de Língua Oficial Portuguesa, neste contexto, Moçambique foi o primeiro país escolhido, atendendo ao desenvolvimento económico à paz e estabilidade, para acolher uma Delegação Permanente. Assume como principais competências:

- Negociação com entidades nacionais e internacionais com vista à criação de mecanismos que facilitem a instalação de jovens agricultores, nomeadamente ao nível do acesso a condições de financiamento competitivas reforçando o capital próprio dos investidores;

- Apoio logístico e informativo, que significa o esclarecimento sobre oportunidades de negócio, regulamentação técnica, funcionamento dos mercados, canais de distribuição, apoio jurídico, entre outros;

- Proporcionar o contacto entre Jovens Agricultores Portugueses e Moçambicanos, na tentativa de estimular um trabalho de parceria e possível constituição de empresas mistas, essenciais ao processo de internacionalização empresarial;

- Reforçar as capacidades dos agricultores moçambicanos com projectos de formação e fomento, entre outros;

- Desenvolver uma cooperação concertada entre as instituições oficiais e os empresários portugueses;

- Manter um contacto permanente com o sector agrícola português, nomeadamente ao nível dos organismos públicos, associações de agricultores, cooperativas, etc.;

- Reforçar a capacidade de intervenção das Associações de Jovens Agricultores Moçambicanos, através de apoio institucional, e formação de dirigentes.

Nos últimos anos foram, de um modo geral, desenvolvidas as seguintes actividades:

- Levantamento de toda a informação sobre investimentos e incentivos fiscais;
- Identificação de eventuais parceiros nacionais privados;
- Identificação de empresas privadas e públicas dispostas a parcerias com os associados;
- Elaboração de contas de cultura;
- Apoios em equipamentos à AJAM (Associação dos Jovens agricultores de Moçambique);
- Participação na FACIM (Feira Internacional de Maputo);
- Elaboração de projectos.
- Elaboração, em conjunto com a Universidade Eduardo Mondlane, dos manuais técnicos da “Colecção Jovem Agricultor”, cada um dedicado a uma cultura;
- Acompanhamento em Moçambique de associados isolados ou em grupo;
- Contactos diversos com entidades oficiais;
- Apoio à Instalação de Jovens Agricultores, beneficiários do Regulamento de Atribuição de Subsídios de Instalação a Jovens Agricultores Portugueses que Iniciem Actividade em Moçambique, bem como acompanhamento e fiscalização da implementação dos respectivos projectos;