Tendo em vista a representação e a defesa activa dos interesses dos Jovens Agricultores Portugueses, a AJAP está associada a várias organizações europeias. Neste contexto, a AJAP marca posição no CEJA e na Euromontana, instituições no seio das quais é a única entidade portuguesa.

Esta representação institucional é importantíssima para a defesa dos interesses e valores dos Jovens Agricultores Portugueses em particular e de todo o Mundo Rural e Agrícola do nosso país.

Também de extrema importância é o trabalho desenvolvido a nível dos Conselhos Consultivos e dos respectivos Grupos Permanentes, a AJAP representa os Jovens Agricultores Europeus no Grupo Permanente das Frutas e Legumes Transformados, Grupo Permanente do Azeite e Produtos Derivados e Grupo Permanente dos Cereais.